Sur l'une des planètes, perdue dans les profondeurs de l'espace, se trouve une race de monstres extraterrestres qui attaquent constamment les planètes qui les entourent. Le commandement de la starfleet de la terre a décidé de détruire cette planète. Dans le jeu Planet Attack Clicker, vous commanderez un navire qui devra accomplir cette mission. Après avoir volé jusqu'à la planète, vous commencerez à bombarder sa surface avec des missiles. Chaque coup le détruira. Divers satellites et autres objets voleront autour de la planète. Vous devez éviter de les frapper avec des missiles, car vous en avez un nombre limité.