Le protagoniste du jeu Undead Crate Boy est un cube qui a pénétré le territoire capturé par les morts-vivants. Notre héros doit collecter un certain nombre de boîtes qui apparaîtront à l'emplacement. Pendant qu'il fait cela, il sera attaqué par des cubes rouges. Ce sont les morts-vivants qui s'en prennent à lui. Vous, contrôlant le héros, pouvez les fuir ou utiliser des armes pour tirer sur des adversaires et obtenir des points pour cela.