L'entraînement des ninjas est varié, mais dans le jeu Flip Ninja, il est complètement unique. Le héros brise toutes les idées sur les lois de la gravité et vole entre deux plates-formes situées au-dessus et en dessous. Votre tâche est de lui donner l'ordre de sauter pour ne pas entrer en collision avec ce qui vole dans l'espace.